背景介紹:
剛發(fā)現外泌體時(shí),這種比多泡體還要小的細胞外囊泡被視為細胞外排出的代謝垃圾,但隨著(zhù)對這種細胞外囊泡不斷地深入研究,發(fā)現這種細胞外囊泡在細胞之間的通訊交流中發(fā)揮著(zhù)極其重要的作用。
外泌體是什么?
外泌體是機體所有活細胞分泌的一種直徑約為30-150nm的細胞外囊泡,廣泛存在于各種生物體液(血液、尿液、母乳、唾液、胸水、腹水、腦脊液等)中。它們由蛋白質(zhì)、脂質(zhì)、核酸的特定成分組成,可以將信號傳遞給受體細胞,從而介導細胞間的通訊。外泌體在多種生物學(xué)功能中發(fā)揮著(zhù)重要作用,包括參與RNA、蛋白質(zhì)、酶和脂質(zhì)等生物分子的轉移,以及各種生理和病理過(guò)程的調節。
外泌體屬于細胞外囊泡的一種,根據直徑大小以及釋放機制的不同可將細胞外囊泡主要分為外泌體、微囊泡、凋亡小體,它們都參與細胞間信息傳遞,但目前對于外泌體的研究最多。
表 外泌體與其他細胞外囊泡的區別
分類(lèi) | 外泌體 | 微囊泡 | 凋亡小體 |
直徑 | 30-150nm | 100-1000nm | 500-4000nm |
密度 | 1.1-1.18g/mL | 1.02-1.22g/mL | 1.16-1.28g/mL |
來(lái)源 | 細胞內的多泡小體與細胞膜融合后,其內的小泡釋放到細胞外 | 細胞膜出芽形成 | 凋亡時(shí)細胞膜皺縮內陷,分割包裹胞質(zhì)形成的泡狀小體 |
內含物 | mRNA、miRNA、非編碼RNA、蛋白(細胞質(zhì)、膜)、MHC | mRNA、miRNA、非編碼RNA、蛋白 | 核組分、DNA、細胞器 |
蛋白標志物 | Alix、TSG101、HSC70、CD63、CD81、CD9 | Selectin、integrins、CD40、MMP | Histones |
功能 | 細胞內通訊、細胞間物質(zhì)交流 | 細胞內通訊、在細胞間運輸遺傳物質(zhì) | 調節病理和生理過(guò)程 |
圖 外泌體與其他細胞外囊泡
外泌體的結構組成:
外泌體具有脂質(zhì)雙分子層結構,由膽固醇、鞘磷脂和磷酸甘油酯等成分共同組成,在其脂質(zhì)雙分子層的表面附著(zhù)有粘附分子、主要組織相容性復合體(major histocompatibility complex,MHC)、大量的特定蛋白質(zhì),包括四跨膜蛋白、熱休克蛋白等等和各種特定的配體(CD9、CD63、CD81等)。在外泌體的內腔中還攜帶各種生物活性物質(zhì),包括核酸、某些酶類(lèi)、蛋白分子、細胞代謝物等,核酸例如信使核糖核酸(messenger ribonucleic acid,mRNA)、微小核糖核酸(micro ribonucleic acid,miRNA)、脫氧核糖核酸(Deoxyribonucleic acid,DNA)和長(cháng)鏈非編碼核糖核酸(Longnon-coding ribonucleic acid,LncRNA)等。
圖 外泌體的結構組成
外泌體的功能:
外泌體的功能起決于其所來(lái)源的細胞類(lèi)型。外泌體能夠將核酸、蛋白質(zhì)和脂質(zhì)在內的多種生物活性分子從供體細胞轉移到受體細胞,介導細胞間通訊和分子轉運;并且外泌體可以由所有類(lèi)型的活細胞分泌,在體液中廣泛分布。它可參與機體免疫應答、抗原提呈、細胞遷移、細胞分化、細胞遷移、腫瘤侵襲等方面,因此外泌體在生理病理標志物和藥物遞送方面有巨大的應用潛力。
外泌體提?。?/span>
進(jìn)行外泌體研究,首先要將其從樣本中提取出來(lái)。目前已有許多基于外泌體物理及生化特性的分離方法,傳統方法包括超速離心、密度梯度離心、超濾、尺寸排阻色譜(size-exclusionchromatography,SEC)、聚合物沉淀法、免疫親和層析,還有一些新的微流體技術(shù)、商業(yè)試劑盒。
圖 外泌體分離純化方法合集
超速離心:
超速離心法是最常用也是分離外泌體的“金標準”方法。其原理是利用溶液顆粒大小和密度導致沉降速率不同,來(lái)分離不同組分。該方法包含以下步驟:低速離心去除細胞和凋亡碎片;其次以更高離心力消除更大囊泡;最后高速離心沉淀外泌體。該方法操作簡(jiǎn)便,可以擴展為大規模外泌體制備。在過(guò)去30年中,超速離心法被廣泛應用于從細胞培養基、血清、體液中分離外泌體。但是該方法特異性不強、可混有分子量相近的蛋白質(zhì),同時(shí)高速離心力可能破壞外泌體膜泡影響下游分析。
圖 超速離心法分離外泌體
密度梯度離心:
密度梯度離心利用顆粒大小與密度差異對外泌體進(jìn)行分離。密度梯度離心會(huì )預先使用蔗糖或碘克沙醇制作密度梯度。樣品從頂部加入離心管,在離心過(guò)程中逐漸自上而下沉降,在一定密度區間聚集。外泌體通常密度范圍為1.1~1.2g/mL。該方法的局限性是分離樣本容量受到密度區帶寬度的限制,因此密度梯度離心不便于處理大樣本。
圖 密度梯度離心分離外泌體
超濾:
超濾是基于外泌體尺寸進(jìn)行分離的方法。根據膜孔的尺寸和截留分子量,將小顆粒通過(guò)膜孔進(jìn)入濾液,大顆粒截留在膜表面。超濾的主要缺點(diǎn)為液體流動(dòng)方向平行膜孔方向,造成大顆粒堵塞膜孔,同時(shí)產(chǎn)生的剪切力也會(huì )使外泌體變形或裂解。
圖 超濾法純化外泌體
尺寸排阻色譜(SEC):
SEC原理為根據顆粒尺寸進(jìn)行分離。在色譜柱中填充多孔固定相,小顆??梢源┻^(guò)固定相中的空隙,因此沉降路徑變長(cháng),較大顆粒更晚沉降,因此可以分離尺寸差別較大的顆粒。通常SEC會(huì )先進(jìn)行超速離心預處理以此減少雜質(zhì)、提高純度。SEC最大的優(yōu)勢是可以很好的保留外泌體活性。
圖 尺寸排阻色譜(SEC)純化外泌體
聚合物沉淀法:
聚合物沉淀原理是利用超親水聚合物,如PEG結合溶液中水分子使溶質(zhì)溶解度降低進(jìn)而沉淀析出,最后通過(guò)低速離心獲得外泌體。可以廣泛用于各種樣品類(lèi)型,如血液、培養基、尿液、腦脊液等。其優(yōu)點(diǎn)是可處理大樣本,產(chǎn)量較高。缺點(diǎn)是分離的外泌體會(huì )受到其他蛋白質(zhì)污染。
圖 聚合物沉淀法純化外泌體
免疫親和層析:
免疫親和層析基本原理通過(guò)配體與抗體特異結合進(jìn)而分離純化。一般用外泌體表面生物標記物作為配體,如四跨膜蛋白超家族、囊泡轉運分類(lèi)內涵體復合物、復合物相關(guān)蛋白??贵w吸附在磁珠、多孔二氧化硅單片板、膜親和過(guò)濾器上,溶液通過(guò)時(shí)可特異結合外泌體表面蛋白進(jìn)行分離純化。常見(jiàn)方法有基于微孔板的酶聯(lián)免疫吸附測定與磁珠免疫捕獲。此類(lèi)方法具有高特異性,并可以保證外泌體生物活性。
圖 磁珠法免疫捕獲外泌體
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